确立了占用水域的管理制度，实行分类管理。针对河道建设占用水域混乱、水土资源利用效率低下的情况，为促进河道内水土资源的合理利用和综合效益的发挥，修订草案规定了三项措施：占用河道水域、岸线资源的应交纳占用费（第十四条）；占用水面与断面的，由建设单位采取补救措施；建设项目对原有水工程设施造成影响的，建设单位应当予以补偿。